王氏保赤丸主要可用于小儿乳滞疳积、痰厥惊风、喘咳痰鸣、乳食减少、吐泻发热、大便秘结、四时感冒以及脾胃虚弱、发育不良等症。王氏保赤丸中的南星、川贝等入肺经，大黄、黄连等入胃大肠经，大肠与肺相表里，一并清热化痰、健脾消食。这几种中药材相互作用可以加快肺部湿罗音及痰鸣音消失的速度。

另外，王氏保赤丸的方剂中还有生姜淀粉、荸莽粉等药用成分，这些成分均有有健运脾胃的功效。中医认为，脾胃是后天之本，王氏保赤丸正是主治主治脾胃虚弱、胃呆食减、便秘、腹泻等症，且治疗效果显著。从制剂组成上来讲，王氏保赤丸中的各味药物的作用有强有弱，有些有毒，不宜大量久服，有些则是无毒的保健食材。王氏保赤丸能相传百年必定有其秘方的奥妙之处，因此这一种药物也是极受家长肯定的一种儿科良药。