孕酮低主要有以下几方面的原因，具体包括：

内分泌系统出现了异常，比如内分泌功能低下，就可以导致孕酮含量低下。

因为内分泌系统在体内可以分泌多种激素，当内分泌功能低下时机体就无法合成足量的孕酮，从而导致孕酮含量偏低。

可能是因为有慢性妇科炎症，比如慢性阴道炎、盆腔炎、子宫内膜炎以及输卵管炎等。

当女性患有这些慢性妇科炎症的时候，也可以干扰到内分泌系统的功能，从而导致内分泌系统功能低下而引起孕酮含量低下。

可能是肝脏或肾脏出现了问题，因为孕酮在体内合成之后要在血液中存留一段时间，然后由肝脏灭活经肾脏排出体外。

如果肝功能亢进就可以导致孕酮灭活过快，也可以引起孕酮含量下降。

此外，孕妇在怀孕期间没有注重休息，过度劳累或者不注重饮食，也可能导致孕酮低。

因此，孕妇一旦出现孕酮低的问题，要及时到医院进行治疗，可以在医生指导下服用黄体酮药物或注射黄体酮注射液来补充孕酮，同时注重休息。