卡奥玛卡神庙的通关方法是玩家首先用吸铁石拉开神庙铁门，在击败怪物后，炸掉边上的石头卸下铁门，然后用铁门把石头上的宝箱扫下来。炸开的门可以当踏板。接着玩家用吸铁石吸到二楼平台前当桥，通过后用吸铁石吸下第三个石头可以获得第三个宝箱，集齐宝箱后就能通关了。玩家在该作中主要的回复生命值的方式是吃东西，而将生的食材烹饪熟可以提高生命值的回复量或者赋予玩家一些一次性的额外的心，这些一次性的心会以黄色标示。与此同时，某些食物和药剂还可以为玩家在一段时间内赋予一个增益效果，而这些增益效果会在屏幕的左上角显示出来，比较典型的是辣的食物可以为玩家御寒。该作中林克可以驯服野马作为自己的坐骑，玩家可以在马厩里注册自己的马匹，在注册之后可以为马匹取名。任天堂为了表现马匹的动态专门为马作了动作捕捉，因此玩家可以在游戏中操纵马匹以马术舞步动作原地转圈。玩家在马上作战时可以选择让马匹自动奔跑，而玩家可以专注于作战。除了马匹外，玩家还可以骑乘野鹿等，但不能够在马厩注册，而且奔跑速度较慢。